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根尖切除术是切除牙齿的根尖，刮除根尖周病变组织的手术。适用于根管治疗失败，无法取出根管充填材料的情况;根管弯曲狭窄;根管器械在根管内折断，堵塞物堵塞;根尖断裂已形成慢性根尖周炎;慢性根尖周炎并发根管充填材料充填过多，难以取出。
一般只用于前牙和前磨牙，磨牙可根据其解剖情况处理。术前摄x线片，了解牙根形态、位置、与邻近组织的关系、骨质破坏范围及根管治疗情况。手术前最好做根管充填，或者手术的同时做根管充填。
术前半小时可以酌情给病人通过口服使用镇静剂和抑制患者唾液以及分泌的药物。手术区消毒技术预备、备好吸唾器、局麻。在患牙根尖部做半圆形切口，长约1.5～2cm。翻瓣。
确定一个根尖细胞所在地理位置，去骨开窗，显露患牙根尖。用刮匙刮净根尖周肉芽等病变组织，用裂钻或凿切断部分去除导致根尖约2mm (尽量少切牙根对于主体，保留牙骨质，至少需要保留相关牙根的2/3)，并将根周骨质与牙根断面锉磨平滑。
清理系统冲洗后，将粘骨膜瓣复回原位，间断缝合。术后护理必要时给予其他抗菌素，1周内不能咬硬物，饭后用生理盐水漱口，保持自己口腔环境清洁，1周后拆线，伤口2周内愈合。术后3个月、6个月、 12个月没有定期检查复查，拍X线片。一般都是新生骨6～12个月时间填满骨腔。
近年来不断有人研究报道用羟基磷灰石(HA)及磷酸三钙(TCP)材料作为骨腔内充填结构材料，显示了明显的生物化学相容性，如果同时再加上骨诱导作用蛋白(BMP)，效果影响更为社会理想。
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